Buah a mi me pasaba algo parecido, tenia un HD sata de 120 seagate, y otro sata de 160maxtor, si pasaba del 160 al de 120 se jodian los rar, los zip y los videos, si lo hacia al reves iva bien...
Yo fui a la web de seagate y baje un prog para hacer test del HD, te recomiendo q investigues por ayi y si no lo encuentras envia un mail a seagate q te responderan (a mi me respondieron xD )
Eso si, ahora tengo 2 HD Sata Maxtor y un HD de 120 Seagate pa tirar xD al parecer no ordenaba bien los archivos en el disco no encontre sectores defectuosos pero estaba jodido...
Byeah!