Es raro. Para los videos en alta definición por internet probaría el Flash player 10.1 beta, que soporta aceleración por hardware.
Para los videos que tengas descargados probaría cualquiera de las siguientes opciones:
- Reproductor configurado para reproducir usando DXVA (MPC, KMPlayer, etc)
- Reproductor configurado para reproducir usando CoreAVC (los mismos que antes o cualquier otro).
- Usar un reproductor que se llama Splash y que tiene un codec propio que aprovecha la GPU.