Instalación de Windows y particiones, no puedo iniciar windows 10

Muy buenas a todos.

En mi portatil MSI tenía un SSD 256gb M.2. donde estaba instalado Windows 10. A través de un PEN booteable he instalado windows 10 en un ssd pcie 4.0 que he instalado y en la propia instalación de windows he formateado el ssd antiguo.

Acaba la configuración y todo muy bien, inicia todo bien, Windows 10 aparece ocupando espacio en el ssd de 1tb y mis primeros archivos y el ssd de 256gb aparece completamente formateado.

Aquí viene el problema. Retiro una vez terminado el ssd de 256 del portatil y al hacerlo, el portatil no inicia, me envia directamente a la bios y el disco duro nuevo no me aparece para ponerlo en opciones de BOOT de la bios. Vuelvo a instalar el ssd de 256gb que tengo formateado y de nuevo windows 10 inicia perfectamente. Al iniciar windows me pregunta si quiero iniciar:

-Windows 10 fuente 7
-Windows 10 fuente 4

Al hacerlo en el primero me inicia windows perfectamente desde el ssd nuevo. Al darle al segundo pone reparacion de archivos de windows (entiendo que intenta lanzarlo desde el ssd antiguo).

Que he hecho mal? Quiero que el ssd nuevo de 1tb funcione completamente independiente y quitar del pc el antiguo para venderlo.

EDITO: El SSD Antiguo tenía una partición EFI, que ahora al formatear no existe. Tiene algo que ver? no entiendo nada.
Al parecer el asistente de windows, uso el SSD original para poner ahi el arranque de windows. Una opcion seria quitar el SSD antiguo y dejar solo el SSD nuevo e instalar de nuevo windows. O la otra, quitando el SSD antiguo, poner la memoria USB de instalacion y ver de instalar solo el sistema de arranque a ese SSD nuevo, con las herramientas de recuperacion

https://www.aboutespanol.com/reparar-wi ... ca-3508024
https://www.descargarrufus.com/reparar- ... windows-10
https://www.ubackup.com/es/windows-10/u ... ws-10.html


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@TRASTARO muchísimas gracias compañero! Tiene toda la pinta que es lo que dices. En cuanto arregle el problema de la bisagra que tengo en otro hilo abierto, me pondré con esto y yo creo que con el Pen de instalación sin otro disco duro se debe arreglar.

Le doy a la opción reparar equipo no? Eso me mantiene todo? Ya que tengo todo todo instalado ya y es una pereza volver a empezar... Me he leído los hilos pero no me queda claro el tema de mantener los archivos solo recuperando el arranque.
Solo agregaria el sistema de arranque al SSD [bcd, Boot Configuration Data]
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