Un formateo normal y corriente(no rapido) ya te aisla los sectores defectuosos que pueda tener tu disco duro, aunque creo (de esto ya no estoy muy seguro) que los programas de diagnostico de superficie, siguen pasando por "encima" de esos sectores dañados e irreparables y te siguen dando fallos( no he tenido muchos sectores defectuosos en mi vida ejeej ), pero el disco sigue siendo confiable.
¿Un formateo a bajo nivel no es ese que tarda tantisimo y que dura muchisimas horas? Salvo que tengas un problema grave que no puedas reparar por metodos tradicionales no te lo aconsejo.