si es sata puede ser por eso, las conexiones sata muchas veces se conectan como "extraibles", y se habilitan y deshabilitan como un USB, ademas de que estas conexiones son muy delicadas, yo tb tuve un problema y resulto ser porque un cable sata estaba un poco salido y girado, y no hacia bien contacto. asegurate de esas 2 cosas, todo puede ser que si tienes varios sata tengas que ponerlos en RAID, sino puede pasarte cosas como las que comentas