Vale, ha sido un fallo mio. El problema se da cuando abres otra pestaña (me acabo de dar cuenta).
En esa nueva pestaña, se pone el tamaño de fuente por defecto. No sé si en el diseño antiguo pasaba lo mismo, ya que mi tamaño de fuente era el predeterminado (que no era tan grande). El resto de las preferencias se guardan bien (o aun no he topado con ninguna que haga lo mismo)...
