Acabo de hacer esta prueba: tengo 2 discos duros, y puse a mover varios gigas de archivos de uno a otro, mientras, conecté un disco duro externo usb2 y me puse a reproducir algunos vídeos, ningún problema.
Prueba a conectar el pen a los usb de la placa, no de las extensiones para el frontal de la torre, a mi no me funciona bien el disco duro externo si lo conecto ahí, tiene que ser directo a placa, en los usb de atrás, salu2.