No debe haber ninguna incompatibilidad y como no se como la has "forzado" a entrar, puede ser que este mal conectada, que la fuente sea un super truño y no de, o que te hayas cargado algo....
Como es el resto del PC?
Que potencia "da" la fuente y cuantos A tiene en la linea de 12v?
Lo mejor seria probarlo con todo fuera de la caja.