Me huele a fallo de disco duro. ¿Que marca es?
Ve a la web del fabricante y busca alguna utilidad que te lo chequée.
emmm, más cosas, ¿tu placa base tiene chipset via? y ¿tienes una ATI? he leido por ahí que los drivers de graficas ATI no se llevan bien con los chipsets VIA y pueden causar este problema.