En la página viene bastante bien explicado.
En el archivo que te descargas te vienen distintos archivos, que son como los bloques de guardado de la Memory Card de la PSX. Cada archivo es una partida guardada, más o menos. Estos son los que tienen la extensión .psx.
Con el PSXMemTool puedes meter esos archivos en un archivo Memory Card para luego usarlo con el ePSXe. El ePSXe utiliza para los archivos de Memory Card la extensión .mcr. Una vez creado el .mcr lo único que tienes que hacer es seleccionarlo en el emulador como Memory Card, en Config -> Memory Card.
No lo he probado, pero eso es lo que parece ser. De todas formas, supongo que por ahí también habrá saves de esos dos juegos para PC, puesto que también salieron para esta plataforma.