El windows 98 se instala desde una carpeta del cd, win98 creo que se llamaba.
- Copias todos los ficheros en tu disco duro
- Modificas lo que quieras
- Arrancas el ordenador (si no tienes un disquete de arranque con un cd de arranque que tenga ms-dos)
- ejecutas instalar.exe en la carpeta del disco duro copiada
No se si quedara algun problema pendiente