Formatea el HD desde el HDloader, y para meter los juegos puedes hacerlo por red o conectando por USB con el Hdldump GUI, esta echo en Java, en la firma del usuario "El_Patas" lo tienes además de un Tuto, no te hace falta mas, luego para lanzarlos desde el mismo HDloader o con el Open PS2 Loader, da igual.
Saludos