No se si te he entendido bien. Quieres poner algo en el PC para que al pinchar cualquier cosa en un USB se formatee automaticamente? Me parece como poco peligroso...
Como te han dicho no es complicado en aboluto, pero no creo que tus fines sean tan éticos como dices (si por temas de curro se trata tardas unos 15sg en dar al menu contextual del pendrive y formatearlo).
Si te he entendido mal y lo que quieres es pinchar el pendrive y que formatee una unidad del PC, eso es igual de simple e igual de sucio.
Por ultimo, si lo que pides es que al pinchar el pendrive se formatee a si mismo, no le veo el sentido...