La principal diferencia es que un puerto USB no tiene las prestaciones que tu puerto PCIe. Como todo, depende del uso que vayas a darle. Si necesitas que la red funcione lo más rápida y estable posible, ve por el PCIe. Si lo que quieres es poder navegar, ver Netflix y leer tu correo, el USB va bien.
Eso sí, el USB que pones lo veo muy aparatoso ¿no? Quiero decir, si es para un apaño yo optaría por los famosos USB que son minúsculos, salvo que tengas problemas de cobertura importantes.