Ojo, que si tu controladora es SATA 1, no te valdrá el SATA 3, deberías hacerte como máximo con un SATA 2. Digo esto, por que si aún tu disco principal es IDE, probablemente la controladora sea bastante antigua. Por cierto, haz lo que te dicen, e instala el SO en el SATA, ganarás mucho, y lo que podrías hacer es tener dos particiones, una para el sistema y otra para almacenar datos, y dejar el IDE para almacenar más.