ponte el win2k que ese sí acepta ntfs
creo que hay un programa que hace que win98 pueda leer ntfs, pero desde luego no podrás instalar el SO tal cual sobre ntfs, prueba a hacer 2 particiones (con partition magic), una en fat32 para el SO, buscas el programa, y el resto en ntfs....sin embargo la opcion del win2k es MUCHO más recomendable
si pasas de xp a 98 por requerimientos de hard, el win2k pide como el 98 o así que yo recuerde