NO, no todos los archivos que te detecte el programa tienen porque ser spywares o adwares, etcetera. El "Spybot S & D" puede detectarte a veces algun cambio del registro de Windows o alguna otra cosa que lo interpreta como malware pero no lo es, por eso te dice que lo uses bajo tu responsabilidad. De primeras el propio programa sino recuerdo mal, te daba la opcion de hacer un backup/copia de seguridad del registro de Windows para que si la cagas puedas recuperarlo, asi que te recomiendo que lo hagas por si las moscas.
De todas maneras, usar el Spybot con seguridad no es muy dificil, te recomiendo que cada vez que pases el Spybot y te detecte cosas, vayas a Google y busques lo que te ha encontrado, seguramente te saldran como resultado varios hilos del foro de "forospyware", un gran foro de ayuda sobre spywares, adwares, trojanos y ese tipo de malware en general, con lo cual dandote un paseo por forospyware y buscando en google, podras saber que cosas son malignas y has de borrar y cuales no lo son y debes dejarlas como estan.
Saludos^^.