Supongo que te refieres, a donde se guardan temporalmente, una vez que bajan, para instalarse despues. En Windows 2000, es una carpeta oculta, llamada WUTEMP.
Mientras el WUpdate, te pone que se estan instalando, la buscas, y la copias a otro sitio. Entonces, una vez instalado, se borrará, pero tu ya tendras la copia de los updates.