Para mi eso es una locura, a menos ke no te kede otro remedio.
Un HD conectado a USB es un enorme cuello de botella. Y te robara muchos mas recursos del PC ke una IDE normal, y ademas aunke tengas USB 2.0 (la mas rapida) asta el mas malo de los HD 5.200RPM., dejaria en pañales las transferencias de tu HD USB.
Echa un vistazo en sistema haber si tienes conflictos con ese nuevo hardware.
Mi consejo, pasa de USB para los HD, eso es para los teclados y los MP3.