Pues a priori y siendo un raid 1 no creo que haya problemas aunque no estoy seguro. Si fuera un raid 0 o cualquier otro pues se iría todo al traste pero siendo un raid 1, o sea un disco es espejo del otro, creo que si quitas uno no debería pasar nada, todo lo contrario, estarías poniendo a prueba el raid 1 pues de eso se trata no? de tener todo duplicado en un disco.
Aún así antes de hacer nada un backup bueno no te vendría mal.