Lo que tendrian que hacer es eliminar la basura del ares, no se como hay gente todavia usandolo, si esta cargado de virus, archivos espia, y demas porqueria.
En tu caso puedes reanudar las descargas siempre que quieras tanto si bajas con utorrent, emule, descarga directa (jdownloader o mypony) etc.. solo es tema de configuracion, dinos que programa usarás y te ayudamos