Tienes que buscar una tarjeta pci usb, que disponga de al menos 2 puertos usb internos,o sea con conectores pines.Las que yo conozo las conceptronic y las connection que yo sepa no llevan. Otra opción más sencilla sería intentar deshabilitarlos desde el administrador de dispositivos, vas probando a deshabilitar todos excepto los de la pci, no se si funcionaría, o si no te cojes un alargador usb lo conectas a la pci por detrás y lo llevas hasta el frontal de la caja, solución más chapucera,pero bueno.
Algunas pci llevan un conector usb interno, para conectarlo a los frontales de la caja, pero ya depende de la caja que tengas, las buenas suelen llevar el conector usb y el conector de pines, como sale en la foto más arriba.Podrías usar una de esas pero alguien tendría que hacerte el conector, coger la caja, abrirla y quitar el conector de pines del frontal y soldarle un conector usb, pero no se si te lo harán en una tienda de informática.
Esto también es una buena opción ,pero ya te toca soldar bien, si te fijas han desoldado los conectores usb y han conectado los pines:
