No he leído nada especialmente destacable en cuanto a fallos de esta serie, desde luego no más que de cualquier otro modelo.
Sobre la Z97A, es una placa algo más orientada a una gama económica (todo lo económica que puede ser con dos pciexpress 8x/8x), las fases son más flojas, y tiene menos extras, pero tampoco tiene mucho que envidiar a la Maximus VII.
Cara a overclock, por supuesto, la Maximus es mejor opción. En uso día a día teniendo el procesador de stock deberían darte un servicio similar ambas.
Con la BIOS no creo que tengas problemas, ahora mismo que son UEFI es todo bastante intuitivo, incluso en la serie ROG (es más, diría que es de las más sencillas si no te metes en configuraciones muy específicas).
Saludos