A ver, vamos por pasos. ATA es igual que IDE. Si tu placa soporta ATA133 (que va a ser que sí) da igual donde pongas el disco duro que vas a tener ATA133. Ahora bien, la configuración ideal es que coloques el disco duro y las unidades ópticas tal y como te he comentado antes. Y no creo que se te quede ningún puerto libre ya que tienes 4 dispositivos conectados. En tu placa tienes 2 canales IDE (primario y secundario), y cada uno de ellos soporta dos dispositivos (MASTER y SLAVE). Digamos que el orden de importancia es este (de más importante a menos importante):
Primario Master
Secundario Master
Primario Slave
Secundario Slave
Espero haberte aclarado algo. Un saludo.