Comprimir archivo por archivo

find /path/completo/ -type f -exec zip -rm "{}" "{}" \;

Donde /path/completo/ es la ruta completa al directorio donde se encuentran los ficheros, ya si quieres acotar más pones más controles en el find como un -name, etc...

Te recomiendo que elimines todos los espacios de los ficheros, en linux no es recomendable usar espacio, ni caracteres especiales en los nombres de ficheros y directorios, usa "_" o "-", etc.. sin las comillas claro, para separar.

es por los espacios si. entrecomilla los nombres y prueba otra vez.

Al final lo hize de la siguiente manera los espacios los cambie por _ .

for f in * ; do mv "$f" "${f// /_}" ; done
for file in `ls -1`; do zip "$file".zip "$file"; done

Y luego con pyrename lo cambie de nuevo a espacio. Gracias porla ayuda.