Fácil, sencillo, gratuito y para toda la familia
#!/bin/bash
mencoder -dvd-device $1 dvd:// -of mpeg -oac mp3lame -ovc copy -o $2 -chapter $3-$4
Eso lo guardas, por ejemplo, como
extraer-capitulo.sh, le das permiso de ejecución con:
chmod +x extraer-capitulo.sh
Y lo usas así, suponiendo que tienes la carpeta en el disco duro, la que contiene el TS_VIDEO y demás mandanga en la ruta /home/tu/peli, que quieres extraer sólo el primer capítulo y que el archivo de salida será /home/tu/capitulo.mpeg
extraer-capitulo.sh /home/tu/peli /home/tu/capitulo.mpeg 1 1
Y a correr, eso te debería funcionar.
A partir de ahí, sólo tienes que convertir el mpeg al formato que te de la gana o dejarlo como está para editarlo y posteriormente convertirlo. Si quieres pasarlo directamente a AVI (xvid+mp3 por ejemplo), echa un ojo a la ayuda de mencoder.
Si usas Windows, te vale igual, pero en vez de un script tienes que abrir una línea de comandos y meter la orden a mano.