Para formatear un disco duro o arrancas desde el CD/DVD o metes el CD del XP en windows. Metiendo el CD desde windows lo que te hace es dar la orden al disco duro que en vez de que arranque desde el disco duro arranque desde el CD, así que no hace ni que modifiques nada en la bios.
Una vez que te haya arrancadO desde el CD y comience la instalación del XP en MSDOS, dile que quieres instalar WXP y te dirá en que partición. Borra la partición, y seguidamente te pedirá que formatees el espacio no particionado y tras formatear se instalara el WXP.
Salu2