No sé si será la mejor opción, pero se me ocurre que configures la "mezcla estéreo" como el dispositivo de grabación por defecto, y con cualquier programa de edición de sonido (ejemplo: audacity) te pongas a grabar (pero cuidado con los sonidos de windows, de messenger u otra cosa que hagas, que te lo graba todo).
volumen de windows > opciones > propiedades > grabación > Mezcla stéreo (o como se llame en tu PC) > aceptar > (seleccionar su casilla)