Más que la resolución, (que también) es la conectividad.
S-Video -> Conectable al 100% de las teles modernas, aunque es el de peor calidad (vídeo compuesto, calidad de TV)
VGA -> Conectable a los monitores de PC, y algunas pantallas de plasma, LCD y proyectores llevan este conector. La resolución por tanto es mejor, y la calidad de los colores también.
Personalmente, o llevan los dos o no compraba ninguno, pero en caso de tener que elegir sí o sí, pues S-Video, pues aún no tengo, a parte del PC, ningún sitio dónde merezca la pena conectar la VGA y poder apreciar la mejora.