Yo, personalmente, prefiero la externa por no depender de ningún tipo de software. Siempre la tendrás funcionando, seguro que no afecta ni en un 1% al rendimiento de la aplicación/juego con el que lo uses, puedes grabar en escritorio, en programas que no sean juegos para el shadowplay, todo almacenado externamente en su propio disco duro para las capturas, etc ...
Siempre y cuando uno se la pueda permitir, claro está. Además sin descontar que lo conectas donde quieras sin depender de tener una AMD o una NVIDIA, usar el portatil que puede usar una intel, etc ...
Que usas linux? sin problemas, windows? sin problemas, un SO desconocido? sin problemas. Vamos, no depender de software es lo mejor del mundo para todo.