Ethernet transporta la señal en pares diferenciales, con regeneración y corrección de errores en cada extremo, y es digital, si bien es cierto que se usan varios niveles (en 1000BASE-T, lo más común, PAM5, es decir, 5 niveles) no es exactamente una señal analógica como la de antena que se va degradando. O sincroniza a su velocidad o, si no es posible, utiliza una velocidad menor más resistente a interferencias y menos exigente con los niveles de atenuación, pero nunca te van a llegar 900mbps en lugar de 1000 por tener los cables en mal estado o muchos empalmes.
Es cierto que cuantos menos puntos de conexión mejor, pero dentro de unos límites. Por poder puedes dejar el cable metido en los tubos como dices con los dos extremos al aire para el router y para el PC, eso es lo ideal en el sentido de menos conexiones y menos puntos de fallo, pero si por un tirón o lo que sea se daña el cable la reparación es mucho más problemática, y estéticamente un cable colgando queda muy cutre.
Como comentan los compañeros yo pondría rosetas, en tiradas cortas y con conectores decentes da poco más o menos igual. Incluso para 2.5Gbps y 5Gbps salvo cosas muy chapuceras.
Saludos