Desde el YasT2 de SuSE (instalador de la distribución), cuando llegue al paso de manejar las particiones del disco duro para instalarse ella puedes borrar las particiones de MDK.
gracias al final lo solucioné al instalar el suse 9.0 me detecta el mandrake y me pregunta si lo deseo eliminar, lo elimina y me instala el suse como instalacion nueva.