Supongo que usas windows... yo no. Te pongo cómo se haría desde linux en terminal. Si no lo tienes, podrías desde un livecd montando la partición.
Si no, pues para que te hagas una idea de cómo sería mediante comandillos, tendrías que transformar esto (es shell script bash) al formato de la terminal de windows, que no sé ni cómo se llama.
TMP="tmp"
mkdir $TMP
for i in *; do
if [ $i != $TMP ]; then
cp $i/* $TMP/$i
rm -r $i
fi
done
mv $TMP/* .
rmdir $TMP
Tendrías que situarte en el directorio donde tienes todas las carpetas ésas y ejecutar eso. Si tienes un directorio "tmp", cambia en la primera línea "tmp" por lo que quieras, sin quitar las comillas.
En fin, no sé si te servirá de algo. Saludos
Edito: no había tenido en cuenta los espacios. Te lo pongo en una línea, por si lo llegas a usar, que no creo

TMP="tmp"; mkdir "$TMP"; for i in *; do if [ "$i" != "$TMP" ]; then cp "$i/"* "$TMP/$i"; rm -r "$i"; fi; done; mv "$TMP/"* .; rmdir "$TMP"