Usando solo dos la potencia del cable se limita a 300W. Si la gráfica funciona con el TDP limitado o no arranca directamente es decisión del ensamblador. En todas las 4090, que yo sepa, funciona conectando 3 de 4 en circunstancias similares.
¿No tienes más cables en la fuente? ¿Qué modelo exacto de fuente es? Incluso si tienes que poner un cable con dos terminales, es deseable que estén los 3 en estas gamas. Si no busca un cable custom para tu fuente.
Saludos