Hola
Veo que andas un poco perdido en el tema de los componentes, intentaré explicarte alguna cosilla.
El formato de las placas y cajas es ATX desde hace ya bastantes años. Eso sí, dentro del ATX tienes variantes como el micro-atx, que son unas atx más reducidas para que quepan en cajas más pequeñas. Si lo que buscas es una caja de reducidas dimensiones puedes optar por este formato pero como todo tiene sus contras, perderás algúna ranura pci, menos slots para ram, y hay menos opciones de fuentes de alimetación. Para ello la placa tiene que ser micro atx.
En cuanto a la caja cualquiera te vale. Hay muchísimas y cada una tiene algo diferente. Yo soy un fiel consumidor de cajas de aluminio Lian Li, pero todo va en gustos como digo. Busca una que estéticamente te guste y se ajuste al precio que te quieras gastar y ya está. Bajo la sección ATX cualquier caja te vale.
Saludos