Yo no recomendaría usar particiones NTFS en discos usb, porque el NTFS no suele dar muy buenos resultados al usarlo en distintos ordenadores.
Es porque del NTFS hay un montón de versiones, y se supone que son compatibles todas entre si, pero como otras cosas de Microsoft que se supone que no dan problemas al final acaban dandolos. Yo por ejemplo cuando puse el disco duro del pc viejo en el nuevo cogió se rallo en NTFS y por poco me jode todos los datos, me empezó a hacer comprobaciones del disco al inicio y decía que reparaba cosas pero en realidad se las cargaba, por suerte al final conseguí acceder cambiandole el formato a FAT32 (Sin formatearlo, haciendolo desde el partition magic).
Vamos que aunque se pueda yo no lo haría, antes que eso puedes hacer otras cosas en caso de que necesites pasar una imagen de un DVD, como por ejemplo meterla en un rar/zip (incluso sin compresion si no quieres perder tiempo) de esos que se dividen en varios, asi no tendrás problemas.