Es posible 100%.
Yo lo he hecho en un pendrive, me ocupaba unos 100 megas. El arranque es muy lento, pero bueno.
Este programa lo que hace es que te genera un "mini-sistema operativo", basado en windows igual que un live cd, tiene opciones minimas pensadas para restauracion de sistemas, recuperacion de datos, etc,etc.
Este es para crear un
live CD, a partir de un cd de windows original:
http://www.nu2.nu/pebuilder/
Y este es la otra opción para poder adaptarlo a un
USB:
http://www.nu2.nu/pebuilder/files/pe2usb101.zip
Para que te funcione en el pendrive, tienes que instalarlo y formatearlo con la utilidad pe2usb, si lo haces copiando y pegando, no te funcionará.