¿te pide el boot.ini? es que no entiendo muy bien que te ha pasado. Supongo que tenias Wxp en C y el Me en otra unidad, has formateado C y has perdido todo lo del arranque, ¿no?
Ahora no recuerdo (nunca he usado el Me) como era el arranque del Me. no se si funcionaba con el boot.ini o con el Autoexec.bat y el config.sys
Si es con el boot.ini te puedo poner el del XP, y lo modificas para el Me y tu instalacion en concreto:
[boot loader]
timeout=30
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional"
/fastdetect
PEro sigo pensando que, al ser un no NT, deberia ir con autoexec y config. Si alguien lo usa que lo diga por aqui.
Saludos!