Te voy a decir los pros y contras q en mi opinion tiene ntfs:
A_Pros:Se puede trabajar con archivos grandes y creo qse puede enriptar.
B_Contras: si se te jode con un disco de inicio no vas a poder ver el contenido del disco duro.
Yo te recomendaria q hicieses 2 particiones en ntfs, unas de unos 5 gigas para el so y otra con el resto donde meterias todos los programas y demas, asi si se te jode con formatear el c y volver a instalar el so en el c no se perderia nada ya q todos los documentos los guardas en el d
Salu2