Pues depende.
Si tienes una placa base que lleve puertos Serial ATA pues optaria por discos Serial ATA, si no lleva veo una tonteria pagar un sobreprecio por disco duro + controladora.
La diferencia de velocidad es muy poca, en esta caso influye mas la diferencia entre marcas.
Solo por la mejora en los cables de conexion y no tener que usar los cables de 80 hilos ya es una gran ventaja, tanto en comodidad como en refrigeracion.
Otra ventaja del SATA respecto al PATA, cada disco emplea todo el ancho del bus de conexion, ya que no lo comparte con nadie mas.
La diferencia de precio no seria un motivo para decidir entre unos u otros.
Ahora una duda que dejo en el aire, en los discos PATA, al compartir bus con por ejemplo un lector de CDs, la velocidad del disco se reduce a la del dispositivo mas lento?
La diferencia entre ATA100/133 es nula.
Salu2
