Sonido entrecortado en Batocera

La semana pasada murió mi Athlon 64 3200+ (Monocore a 2000Mhz) y lo he cambiado por un Core 2 Duo E8400 a 3000Mhz con 8Gb de ram y una GT9400.
Con el anterior ordenador no tenia ningún problema, solo en PSX el sonido petardeaba un poco, sonaba entrecortado, pero perfectamente jugable. En cambio con el nuevo y mucho más potente el sonido sale entrecortado en todos los juegos, sean Mame, Neogeo, N64... Durante los menus y previsualizando los videos de cada juego el sonido es perfecto y sin cortes, solo pasa al empezar a jugar a cualquier juego.
¿Alguna solución?
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