Las tomas de ventiladores dan 12v, pero ojo que no siempre (y puede que sea lo que te está pasando).
Hay placas que destinan algunos de sus conectores para la bomba, suelen especificarse como cpu2, o pump. Y si no es un conector específicamente para ésto, debes asegurarte que el conector donde conectes trabaje en modo pwm, que es el que ofrece 12v constantes.
Y si no quieres lios, un adaptador como el que te han puesto, ya sea de molex o de sata, que tambien saca 12v.