Cuando usas un monitor 144hz o mas y otro secundario de 60 (o 75), a mucha gente, le da problemas, normalmente de perdida de frames en el primario, si en el secundario esta youtube por ejemplo, pero no ocurre si es un juego a pantalla completa, solo si es en ventana o ventana completa. Tambien ocurren parpadeos leves de brillo. Si buscas en google veras que se habla de este problema.
Si pones en el segundo monitor youtube, y el primario la famosa pagina del ovni para ver los fps y demas, lo notarás enseguida.
Quizas sea este tu problema, solo que mas grave...
Yo tengo uno a 240hz y el otro a 60, y "solo" me ocurre en juegos en ventana, pero es un incordio que no logro solucionar. Me toca dejar encendido solo el primario si juego a un juego en ventana.