Puedes dejar las dos activadas,dependerá de donde conectas los parlantes,si lo haces en la integrada en el icono del volumen en windows,le das clik derecho y se despliega las opciones para elegir el dispositivo de audio,hay puedes seleccionar tanto el realtek (integrado) o el pciE,si quieres usar la tarjeta de sonido deveras (como es lógico),conectar los parlantes/cascos en la tarjeta de sonido que implementes y acto seguido seleccionarla en windows.
En mi caso uso 3 dispositivos de audio incluido el integrado.