De todo lo que has nombrado, sólo los programas (y juegos), y no todos. Hay programas que permiten ser instalados globalmente, mientras que otros sólo para el entorno del usuario que lo instala; generalmente lo suele preguntar el programa en cuestión en el proceso de instalación. Igualmente, para que un programa pueda ser instalado globalmente, suele requerir que un administrador lo instale.
De todas formas, para que que el entorno del usuario esté protegido en cuanto a datos, cookies, historiales y demases, los usuarios no deben de tener privilegios de administrador; de otra forma, cualquier usuario escalando privilegios podría entrar en el entorno de otro usuario y ver sus datos.