Pues no he probado ninguna de las 2, de la 6D no hablan mal (aunque se esperaba más), lo que sí te digo es que tengas en cuenta el precio de los objetivos, porque son varias veces más caros que los de sensor recortado.
Si no inviertes en objetivos puede incluso que saques peores fotos que con una no fullframe.
Por poder recomendarte mejor ¿Qué estás buscando en una fullframe? Lo digo porque si quieres mayor desenfoque, perfecto, pero el resto de ventajas que se les suelen atribuir son discutibles, cuando no son directamente mentira.
Aquí puedes ver una comparativa de sensores entre las 2 que has dicho tu. En cuanto a sensor, la Nikon es muy superior:
https://www.dxomark.com/Cameras/Compare ... __1170_915Tiene dos pasos más de rango dinámico (lo cual se traduce en menos ruido en las sombras, un cálculo rápido sería 4 veces menos ruido), una profundidad de color mayor y mejor comportamiento en ISOs altos (aunque en esto sólo ligeramente mejor). En otras palabras, en cuanto a imagen es bastane superior, luego te toca mirar si la 6D tiene alguna característica fuera de la calidad de imagen que te interese más.
Nikon suele ser más caro, tanto cámara como objetivos, cosa a tener en cuenta.