@Dios Horus Yo te diria lo mismo que el compañero, abrelo (MSI no te invalida la garantia ademas, asi que aprovecha), y echale un ojo bien a fondo sobre cualquier cosa que pueda estar provocando que se sobrecaliente.
Segun puedes ver por internet, la distribucion interna de tu portatil no es mala, aunque ten en cuenta que tienes cerca del HDD la CPU, y aunque este bien refrigerada, todo lo que provoque calor no ayuda precisamente a que esté en las condiciones mas frescas.
Asi viendo esto, tu portatil estando limpio deberia ser asi o muy parecido. Si lo desmontas, y no tiene nada se suciedad, deberias pensar en cambiar la pasta termica o el 'Thermal pad' que suelen llevar estos equipos, es posible que el procesador no este disipando bien hacia los ventiladores y lo este disipando a traves de la placa, con lo que el calor se desplazaria hacia el teclado, que es posible que sea lo que notas tu como calor.
Tambien es cierto, que si cambias el HDD por un SSD, algo ayudara.