Cuando se tiene sólo un disco, lo recomendable es hacerle una partición para el SO.
Aparte de eso, es normal que según pase el tiempo pierda rendimiento, por fragmentación de archivos, uso del archivo de intercambio en la misma unidad, y adición de aplicaciones al inicio de sesión.
La mejor solución es añadir otro disco, preferiblemente un SSD para el SO, aplicaciones más usadas y archivo de intercambio.
Si no es posible, debes mantener una dsiciplina de optimización bastante severa, pasando por particionar el disco y asignar una función a cada partición, de manera que la fragmentación sea localizada y no afecte al rendimiento general. Igualmente, es aconsejable reducir el número de programas que se inician con la sesión al mínimo imprescindible.
