¿Y no hiciste ninguna prueba extrayendo la fuente FUERA de la caja para comprobarlo? Yo lo haría, y así realmente confirmas el problema.
Podría ser:
- Avería en la fuente
- Rejilla tapa demasiado el flujo del aire (con la fuente fuera pon la mano delante del ventilador para comprobar a qué me refiero)
- Mal anclaje de la fuente, vibración
- Mal anclaje de la tapa, vibración
- Mal anclaje de otra parte del equipo, vibración
Si el ventilador se orienta hacia abajo en tu equipo debería ser la instalación "natural" de una fuente similar, no está al revés. Piensa que suelen estar ubicadas sobre la CPU en esa orientación. Además, si la instalaras al revés, creo que el flujo de aire quedaría obstruído por la tapa y tendrías un problema más grave que el ruido.
Saludos.