La latencia que tomarán será la de la más alta, y al contrario con la frecuencia.
Diferencia entre un CL9 y un CL10, a efectos prácticos de rendimiento, ninguna; con la frecuencia tres cuartos de lo mismo: sólo lo notaremos si la diferencia es realmente grande (1600 a 2400)
Lo malo a la hora de añadir módulos es que aún siendo del mismo modelo y fabricante no te aseguras al 100% que sean compatibles entre sí, no es tanto problema de que baje rendimiento al mezclar características, sino la compatibilidad.
En principio, no debería haber ningún problema, cada par en un canal y luego ajustar la BIOS.